fetch-pack: print and use dangling .gitmodules
[git] / Documentation / git-update-index.txt
1 git-update-index(1)
2 ===================
3
4 NAME
5 ----
6 git-update-index - Register file contents in the working tree to the index
7
8
9 SYNOPSIS
10 --------
11 [verse]
12 'git update-index'
13              [--add] [--remove | --force-remove] [--replace]
14              [--refresh] [-q] [--unmerged] [--ignore-missing]
15              [(--cacheinfo <mode>,<object>,<file>)...]
16              [--chmod=(+|-)x]
17              [--[no-]assume-unchanged]
18              [--[no-]skip-worktree]
19              [--[no-]ignore-skip-worktree-entries]
20              [--[no-]fsmonitor-valid]
21              [--ignore-submodules]
22              [--[no-]split-index]
23              [--[no-|test-|force-]untracked-cache]
24              [--[no-]fsmonitor]
25              [--really-refresh] [--unresolve] [--again | -g]
26              [--info-only] [--index-info]
27              [-z] [--stdin] [--index-version <n>]
28              [--verbose]
29              [--] [<file>...]
30
31 DESCRIPTION
32 -----------
33 Modifies the index. Each file mentioned is updated into the index and
34 any 'unmerged' or 'needs updating' state is cleared.
35
36 See also linkgit:git-add[1] for a more user-friendly way to do some of
37 the most common operations on the index.
38
39 The way 'git update-index' handles files it is told about can be modified
40 using the various options:
41
42 OPTIONS
43 -------
44 --add::
45         If a specified file isn't in the index already then it's
46         added.
47         Default behaviour is to ignore new files.
48
49 --remove::
50         If a specified file is in the index but is missing then it's
51         removed.
52         Default behavior is to ignore removed file.
53
54 --refresh::
55         Looks at the current index and checks to see if merges or
56         updates are needed by checking stat() information.
57
58 -q::
59         Quiet.  If --refresh finds that the index needs an update, the
60         default behavior is to error out.  This option makes
61         'git update-index' continue anyway.
62
63 --ignore-submodules::
64         Do not try to update submodules.  This option is only respected
65         when passed before --refresh.
66
67 --unmerged::
68         If --refresh finds unmerged changes in the index, the default
69         behavior is to error out.  This option makes 'git update-index'
70         continue anyway.
71
72 --ignore-missing::
73         Ignores missing files during a --refresh
74
75 --cacheinfo <mode>,<object>,<path>::
76 --cacheinfo <mode> <object> <path>::
77         Directly insert the specified info into the index.  For
78         backward compatibility, you can also give these three
79         arguments as three separate parameters, but new users are
80         encouraged to use a single-parameter form.
81
82 --index-info::
83         Read index information from stdin.
84
85 --chmod=(+|-)x::
86         Set the execute permissions on the updated files.
87
88 --[no-]assume-unchanged::
89         When this flag is specified, the object names recorded
90         for the paths are not updated.  Instead, this option
91         sets/unsets the "assume unchanged" bit for the
92         paths.  When the "assume unchanged" bit is on, the user
93         promises not to change the file and allows Git to assume
94         that the working tree file matches what is recorded in
95         the index.  If you want to change the working tree file,
96         you need to unset the bit to tell Git.  This is
97         sometimes helpful when working with a big project on a
98         filesystem that has very slow lstat(2) system call
99         (e.g. cifs).
100 +
101 Git will fail (gracefully) in case it needs to modify this file
102 in the index e.g. when merging in a commit;
103 thus, in case the assumed-untracked file is changed upstream,
104 you will need to handle the situation manually.
105
106 --really-refresh::
107         Like `--refresh`, but checks stat information unconditionally,
108         without regard to the "assume unchanged" setting.
109
110 --[no-]skip-worktree::
111         When one of these flags is specified, the object name recorded
112         for the paths are not updated. Instead, these options
113         set and unset the "skip-worktree" bit for the paths. See
114         section "Skip-worktree bit" below for more information.
115
116
117 --[no-]ignore-skip-worktree-entries::
118         Do not remove skip-worktree (AKA "index-only") entries even when
119         the `--remove` option was specified.
120
121 --[no-]fsmonitor-valid::
122         When one of these flags is specified, the object name recorded
123         for the paths are not updated. Instead, these options
124         set and unset the "fsmonitor valid" bit for the paths. See
125         section "File System Monitor" below for more information.
126
127 -g::
128 --again::
129         Runs 'git update-index' itself on the paths whose index
130         entries are different from those from the `HEAD` commit.
131
132 --unresolve::
133         Restores the 'unmerged' or 'needs updating' state of a
134         file during a merge if it was cleared by accident.
135
136 --info-only::
137         Do not create objects in the object database for all
138         <file> arguments that follow this flag; just insert
139         their object IDs into the index.
140
141 --force-remove::
142         Remove the file from the index even when the working directory
143         still has such a file. (Implies --remove.)
144
145 --replace::
146         By default, when a file `path` exists in the index,
147         'git update-index' refuses an attempt to add `path/file`.
148         Similarly if a file `path/file` exists, a file `path`
149         cannot be added.  With --replace flag, existing entries
150         that conflict with the entry being added are
151         automatically removed with warning messages.
152
153 --stdin::
154         Instead of taking list of paths from the command line,
155         read list of paths from the standard input.  Paths are
156         separated by LF (i.e. one path per line) by default.
157
158 --verbose::
159         Report what is being added and removed from index.
160
161 --index-version <n>::
162         Write the resulting index out in the named on-disk format version.
163         Supported versions are 2, 3 and 4. The current default version is 2
164         or 3, depending on whether extra features are used, such as
165         `git add -N`.
166 +
167 Version 4 performs a simple pathname compression that reduces index
168 size by 30%-50% on large repositories, which results in faster load
169 time. Version 4 is relatively young (first released in 1.8.0 in
170 October 2012). Other Git implementations such as JGit and libgit2
171 may not support it yet.
172
173 -z::
174         Only meaningful with `--stdin` or `--index-info`; paths are
175         separated with NUL character instead of LF.
176
177 --split-index::
178 --no-split-index::
179         Enable or disable split index mode. If split-index mode is
180         already enabled and `--split-index` is given again, all
181         changes in $GIT_DIR/index are pushed back to the shared index
182         file.
183 +
184 These options take effect whatever the value of the `core.splitIndex`
185 configuration variable (see linkgit:git-config[1]). But a warning is
186 emitted when the change goes against the configured value, as the
187 configured value will take effect next time the index is read and this
188 will remove the intended effect of the option.
189
190 --untracked-cache::
191 --no-untracked-cache::
192         Enable or disable untracked cache feature. Please use
193         `--test-untracked-cache` before enabling it.
194 +
195 These options take effect whatever the value of the `core.untrackedCache`
196 configuration variable (see linkgit:git-config[1]). But a warning is
197 emitted when the change goes against the configured value, as the
198 configured value will take effect next time the index is read and this
199 will remove the intended effect of the option.
200
201 --test-untracked-cache::
202         Only perform tests on the working directory to make sure
203         untracked cache can be used. You have to manually enable
204         untracked cache using `--untracked-cache` or
205         `--force-untracked-cache` or the `core.untrackedCache`
206         configuration variable afterwards if you really want to use
207         it. If a test fails the exit code is 1 and a message
208         explains what is not working as needed, otherwise the exit
209         code is 0 and OK is printed.
210
211 --force-untracked-cache::
212         Same as `--untracked-cache`. Provided for backwards
213         compatibility with older versions of Git where
214         `--untracked-cache` used to imply `--test-untracked-cache` but
215         this option would enable the extension unconditionally.
216
217 --fsmonitor::
218 --no-fsmonitor::
219         Enable or disable files system monitor feature. These options
220         take effect whatever the value of the `core.fsmonitor`
221         configuration variable (see linkgit:git-config[1]). But a warning
222         is emitted when the change goes against the configured value, as
223         the configured value will take effect next time the index is
224         read and this will remove the intended effect of the option.
225
226 \--::
227         Do not interpret any more arguments as options.
228
229 <file>::
230         Files to act on.
231         Note that files beginning with '.' are discarded. This includes
232         `./file` and `dir/./file`. If you don't want this, then use
233         cleaner names.
234         The same applies to directories ending '/' and paths with '//'
235
236 USING --REFRESH
237 ---------------
238 `--refresh` does not calculate a new sha1 file or bring the index
239 up to date for mode/content changes. But what it *does* do is to
240 "re-match" the stat information of a file with the index, so that you
241 can refresh the index for a file that hasn't been changed but where
242 the stat entry is out of date.
243
244 For example, you'd want to do this after doing a 'git read-tree', to link
245 up the stat index details with the proper files.
246
247 USING --CACHEINFO OR --INFO-ONLY
248 --------------------------------
249 `--cacheinfo` is used to register a file that is not in the
250 current working directory.  This is useful for minimum-checkout
251 merging.
252
253 To pretend you have a file at path with mode and sha1, say:
254
255 ----------------
256 $ git update-index --add --cacheinfo <mode>,<sha1>,<path>
257 ----------------
258
259 `--info-only` is used to register files without placing them in the object
260 database.  This is useful for status-only repositories.
261
262 Both `--cacheinfo` and `--info-only` behave similarly: the index is updated
263 but the object database isn't.  `--cacheinfo` is useful when the object is
264 in the database but the file isn't available locally.  `--info-only` is
265 useful when the file is available, but you do not wish to update the
266 object database.
267
268
269 USING --INDEX-INFO
270 ------------------
271
272 `--index-info` is a more powerful mechanism that lets you feed
273 multiple entry definitions from the standard input, and designed
274 specifically for scripts.  It can take inputs of three formats:
275
276     . mode SP type SP sha1          TAB path
277 +
278 This format is to stuff `git ls-tree` output into the index.
279
280     . mode         SP sha1 SP stage TAB path
281 +
282 This format is to put higher order stages into the
283 index file and matches 'git ls-files --stage' output.
284
285     . mode         SP sha1          TAB path
286 +
287 This format is no longer produced by any Git command, but is
288 and will continue to be supported by `update-index --index-info`.
289
290 To place a higher stage entry to the index, the path should
291 first be removed by feeding a mode=0 entry for the path, and
292 then feeding necessary input lines in the third format.
293
294 For example, starting with this index:
295
296 ------------
297 $ git ls-files -s
298 100644 8a1218a1024a212bb3db30becd860315f9f3ac52 0       frotz
299 ------------
300
301 you can feed the following input to `--index-info`:
302
303 ------------
304 $ git update-index --index-info
305 0 0000000000000000000000000000000000000000      frotz
306 100644 8a1218a1024a212bb3db30becd860315f9f3ac52 1       frotz
307 100755 8a1218a1024a212bb3db30becd860315f9f3ac52 2       frotz
308 ------------
309
310 The first line of the input feeds 0 as the mode to remove the
311 path; the SHA-1 does not matter as long as it is well formatted.
312 Then the second and third line feeds stage 1 and stage 2 entries
313 for that path.  After the above, we would end up with this:
314
315 ------------
316 $ git ls-files -s
317 100644 8a1218a1024a212bb3db30becd860315f9f3ac52 1       frotz
318 100755 8a1218a1024a212bb3db30becd860315f9f3ac52 2       frotz
319 ------------
320
321
322 USING ``ASSUME UNCHANGED'' BIT
323 ------------------------------
324
325 Many operations in Git depend on your filesystem to have an
326 efficient `lstat(2)` implementation, so that `st_mtime`
327 information for working tree files can be cheaply checked to see
328 if the file contents have changed from the version recorded in
329 the index file.  Unfortunately, some filesystems have
330 inefficient `lstat(2)`.  If your filesystem is one of them, you
331 can set "assume unchanged" bit to paths you have not changed to
332 cause Git not to do this check.  Note that setting this bit on a
333 path does not mean Git will check the contents of the file to
334 see if it has changed -- it makes Git to omit any checking and
335 assume it has *not* changed.  When you make changes to working
336 tree files, you have to explicitly tell Git about it by dropping
337 "assume unchanged" bit, either before or after you modify them.
338
339 In order to set "assume unchanged" bit, use `--assume-unchanged`
340 option.  To unset, use `--no-assume-unchanged`. To see which files
341 have the "assume unchanged" bit set, use `git ls-files -v`
342 (see linkgit:git-ls-files[1]).
343
344 The command looks at `core.ignorestat` configuration variable.  When
345 this is true, paths updated with `git update-index paths...` and
346 paths updated with other Git commands that update both index and
347 working tree (e.g. 'git apply --index', 'git checkout-index -u',
348 and 'git read-tree -u') are automatically marked as "assume
349 unchanged".  Note that "assume unchanged" bit is *not* set if
350 `git update-index --refresh` finds the working tree file matches
351 the index (use `git update-index --really-refresh` if you want
352 to mark them as "assume unchanged").
353
354
355 EXAMPLES
356 --------
357 To update and refresh only the files already checked out:
358
359 ----------------
360 $ git checkout-index -n -f -a && git update-index --ignore-missing --refresh
361 ----------------
362
363 On an inefficient filesystem with `core.ignorestat` set::
364 +
365 ------------
366 $ git update-index --really-refresh              <1>
367 $ git update-index --no-assume-unchanged foo.c   <2>
368 $ git diff --name-only                           <3>
369 $ edit foo.c
370 $ git diff --name-only                           <4>
371 M foo.c
372 $ git update-index foo.c                         <5>
373 $ git diff --name-only                           <6>
374 $ edit foo.c
375 $ git diff --name-only                           <7>
376 $ git update-index --no-assume-unchanged foo.c   <8>
377 $ git diff --name-only                           <9>
378 M foo.c
379 ------------
380 +
381 <1> forces lstat(2) to set "assume unchanged" bits for paths that match index.
382 <2> mark the path to be edited.
383 <3> this does lstat(2) and finds index matches the path.
384 <4> this does lstat(2) and finds index does *not* match the path.
385 <5> registering the new version to index sets "assume unchanged" bit.
386 <6> and it is assumed unchanged.
387 <7> even after you edit it.
388 <8> you can tell about the change after the fact.
389 <9> now it checks with lstat(2) and finds it has been changed.
390
391
392 SKIP-WORKTREE BIT
393 -----------------
394
395 Skip-worktree bit can be defined in one (long) sentence: When reading
396 an entry, if it is marked as skip-worktree, then Git pretends its
397 working directory version is up to date and read the index version
398 instead.
399
400 To elaborate, "reading" means checking for file existence, reading
401 file attributes or file content. The working directory version may be
402 present or absent. If present, its content may match against the index
403 version or not. Writing is not affected by this bit, content safety
404 is still first priority. Note that Git _can_ update working directory
405 file, that is marked skip-worktree, if it is safe to do so (i.e.
406 working directory version matches index version)
407
408 Although this bit looks similar to assume-unchanged bit, its goal is
409 different from assume-unchanged bit's. Skip-worktree also takes
410 precedence over assume-unchanged bit when both are set.
411
412 SPLIT INDEX
413 -----------
414
415 This mode is designed for repositories with very large indexes, and
416 aims at reducing the time it takes to repeatedly write these indexes.
417
418 In this mode, the index is split into two files, $GIT_DIR/index and
419 $GIT_DIR/sharedindex.<SHA-1>. Changes are accumulated in
420 $GIT_DIR/index, the split index, while the shared index file contains
421 all index entries and stays unchanged.
422
423 All changes in the split index are pushed back to the shared index
424 file when the number of entries in the split index reaches a level
425 specified by the splitIndex.maxPercentChange config variable (see
426 linkgit:git-config[1]).
427
428 Each time a new shared index file is created, the old shared index
429 files are deleted if their modification time is older than what is
430 specified by the splitIndex.sharedIndexExpire config variable (see
431 linkgit:git-config[1]).
432
433 To avoid deleting a shared index file that is still used, its
434 modification time is updated to the current time every time a new split
435 index based on the shared index file is either created or read from.
436
437 UNTRACKED CACHE
438 ---------------
439
440 This cache is meant to speed up commands that involve determining
441 untracked files such as `git status`.
442
443 This feature works by recording the mtime of the working tree
444 directories and then omitting reading directories and stat calls
445 against files in those directories whose mtime hasn't changed. For
446 this to work the underlying operating system and file system must
447 change the `st_mtime` field of directories if files in the directory
448 are added, modified or deleted.
449
450 You can test whether the filesystem supports that with the
451 `--test-untracked-cache` option. The `--untracked-cache` option used
452 to implicitly perform that test in older versions of Git, but that's
453 no longer the case.
454
455 If you want to enable (or disable) this feature, it is easier to use
456 the `core.untrackedCache` configuration variable (see
457 linkgit:git-config[1]) than using the `--untracked-cache` option to
458 `git update-index` in each repository, especially if you want to do so
459 across all repositories you use, because you can set the configuration
460 variable to `true` (or `false`) in your `$HOME/.gitconfig` just once
461 and have it affect all repositories you touch.
462
463 When the `core.untrackedCache` configuration variable is changed, the
464 untracked cache is added to or removed from the index the next time a
465 command reads the index; while when `--[no-|force-]untracked-cache`
466 are used, the untracked cache is immediately added to or removed from
467 the index.
468
469 Before 2.17, the untracked cache had a bug where replacing a directory
470 with a symlink to another directory could cause it to incorrectly show
471 files tracked by git as untracked. See the "status: add a failing test
472 showing a core.untrackedCache bug" commit to git.git. A workaround for
473 that is (and this might work for other undiscovered bugs in the
474 future):
475
476 ----------------
477 $ git -c core.untrackedCache=false status
478 ----------------
479
480 This bug has also been shown to affect non-symlink cases of replacing
481 a directory with a file when it comes to the internal structures of
482 the untracked cache, but no case has been reported where this resulted in
483 wrong "git status" output.
484
485 There are also cases where existing indexes written by git versions
486 before 2.17 will reference directories that don't exist anymore,
487 potentially causing many "could not open directory" warnings to be
488 printed on "git status". These are new warnings for existing issues
489 that were previously silently discarded.
490
491 As with the bug described above the solution is to one-off do a "git
492 status" run with `core.untrackedCache=false` to flush out the leftover
493 bad data.
494
495 FILE SYSTEM MONITOR
496 -------------------
497
498 This feature is intended to speed up git operations for repos that have
499 large working directories.
500
501 It enables git to work together with a file system monitor (see the
502 "fsmonitor-watchman" section of linkgit:githooks[5]) that can
503 inform it as to what files have been modified. This enables git to avoid
504 having to lstat() every file to find modified files.
505
506 When used in conjunction with the untracked cache, it can further improve
507 performance by avoiding the cost of scanning the entire working directory
508 looking for new files.
509
510 If you want to enable (or disable) this feature, it is easier to use
511 the `core.fsmonitor` configuration variable (see
512 linkgit:git-config[1]) than using the `--fsmonitor` option to
513 `git update-index` in each repository, especially if you want to do so
514 across all repositories you use, because you can set the configuration
515 variable in your `$HOME/.gitconfig` just once and have it affect all
516 repositories you touch.
517
518 When the `core.fsmonitor` configuration variable is changed, the
519 file system monitor is added to or removed from the index the next time
520 a command reads the index. When `--[no-]fsmonitor` are used, the file
521 system monitor is immediately added to or removed from the index.
522
523 CONFIGURATION
524 -------------
525
526 The command honors `core.filemode` configuration variable.  If
527 your repository is on a filesystem whose executable bits are
528 unreliable, this should be set to 'false' (see linkgit:git-config[1]).
529 This causes the command to ignore differences in file modes recorded
530 in the index and the file mode on the filesystem if they differ only on
531 executable bit.   On such an unfortunate filesystem, you may
532 need to use 'git update-index --chmod='.
533
534 Quite similarly, if `core.symlinks` configuration variable is set
535 to 'false' (see linkgit:git-config[1]), symbolic links are checked out
536 as plain files, and this command does not modify a recorded file mode
537 from symbolic link to regular file.
538
539 The command looks at `core.ignorestat` configuration variable.  See
540 'Using "assume unchanged" bit' section above.
541
542 The command also looks at `core.trustctime` configuration variable.
543 It can be useful when the inode change time is regularly modified by
544 something outside Git (file system crawlers and backup systems use
545 ctime for marking files processed) (see linkgit:git-config[1]).
546
547 The untracked cache extension can be enabled by the
548 `core.untrackedCache` configuration variable (see
549 linkgit:git-config[1]).
550
551 NOTES
552 -----
553
554 Users often try to use the assume-unchanged and skip-worktree bits
555 to tell Git to ignore changes to files that are tracked.  This does not
556 work as expected, since Git may still check working tree files against
557 the index when performing certain operations.  In general, Git does not
558 provide a way to ignore changes to tracked files, so alternate solutions
559 are recommended.
560
561 For example, if the file you want to change is some sort of config file,
562 the repository can include a sample config file that can then be copied
563 into the ignored name and modified.  The repository can even include a
564 script to treat the sample file as a template, modifying and copying it
565 automatically.
566
567 SEE ALSO
568 --------
569 linkgit:git-config[1],
570 linkgit:git-add[1],
571 linkgit:git-ls-files[1]
572
573 GIT
574 ---
575 Part of the linkgit:git[1] suite